BiotaScope

Clasificación taxonómica y predicción funcional de comunidades microbianas a partir de secuencias amplificadas de 16S/ITS con QIIME2 y PICRUSt2.

Ejemplo QIIME2 Predicción funcional PICRUSt2

Identificación taxonómica mediante alineamiento con bases de datos personalizadas utilizando Kraken2 y Bracken.

Gráfico Krona Volcano Plot Diferencial

Perfilado de rutas metabólicas mediante alineamiento funcional y enriquecimiento, útil para caracterizar el potencial funcional de microbiotas complejas.

Heatmap funcional Gráfico de barras tras comparar funciones ruta a ruta

Procesamiento de datos genómicos y transcriptómicos, con herramientas adaptadas a distintos diseños experimentales.

• Mapeo y ensamblaje de secuencias
• Anotación de variantes y genes
• Transcriptómica (bulk y single-cell RNA-seq)
• ChIP-seq y enriquecimiento funcional